Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CLDN9O95484 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.5 ms