Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RFXAPO00287 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RFXAPO00287 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RFXAPO00287 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.59□□□□□ -2
RFXAPO00287 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RFXAPO00287 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RFXAPO00287 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RFXAPO00287 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RFXAPO00287 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RFXAPO00287 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RFXAPO00287 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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RFXAPO00287 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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RFXAPO00287 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RFXAPO00287 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RFXAPO00287 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RFXAPO00287 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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RFXAPO00287 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
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RFXAPO00287 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RFXAPO00287 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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RFXAPO00287 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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RFXAPO00287 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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RFXAPO00287 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RFXAPO00287 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RFXAPO00287 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RFXAPO00287 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
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RFXAPO00287 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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RFXAPO00287 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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RFXAPO00287 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RFXAPO00287 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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RFXAPO00287 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
RFXAPO00287 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RFXAPO00287 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RFXAPO00287 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RFXAPO00287 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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RFXAPO00287 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RFXAPO00287 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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RFXAPO00287 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RFXAPO00287 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RFXAPO00287 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RFXAPO00287 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RFXAPO00287 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RFXAPO00287 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RFXAPO00287 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RFXAPO00287 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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