Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VPREB3Q9UKI3 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VPREB3Q9UKI3 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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