Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TM7SF3Q9NS93 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TM7SF3Q9NS93 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TM7SF3Q9NS93 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TM7SF3Q9NS93 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TM7SF3Q9NS93 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TM7SF3Q9NS93 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TM7SF3Q9NS93 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TM7SF3Q9NS93 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TM7SF3Q9NS93 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TM7SF3Q9NS93 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TM7SF3Q9NS93 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TM7SF3Q9NS93 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TM7SF3Q9NS93 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TM7SF3Q9NS93 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TM7SF3Q9NS93 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TM7SF3Q9NS93 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.13
TM7SF3Q9NS93 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TM7SF3Q9NS93 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms