Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
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TOP1MTQ969P6 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
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TOP1MTQ969P6 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
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TOP1MTQ969P6 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
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TOP1MTQ969P6 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
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TOP1MTQ969P6 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
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