Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

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Length 813 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SNX29Q8TEQ0 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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SNX29Q8TEQ0 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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