Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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CHCHD4Q8N4Q1 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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CHCHD4Q8N4Q1 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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CHCHD4Q8N4Q1 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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CHCHD4Q8N4Q1 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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CHCHD4Q8N4Q1 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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CHCHD4Q8N4Q1 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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CHCHD4Q8N4Q1 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHCHD4Q8N4Q1 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHCHD4Q8N4Q1 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHCHD4Q8N4Q1 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHCHD4Q8N4Q1 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHCHD4Q8N4Q1 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHCHD4Q8N4Q1 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHCHD4Q8N4Q1 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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