Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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USP53Q70EK8 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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USP53Q70EK8 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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USP53Q70EK8 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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USP53Q70EK8 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
USP53Q70EK8 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
USP53Q70EK8 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP53Q70EK8 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP53Q70EK8 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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USP53Q70EK8 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
USP53Q70EK8 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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USP53Q70EK8 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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USP53Q70EK8 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP53Q70EK8 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP53Q70EK8 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP53Q70EK8 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP53Q70EK8 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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