Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NFE2Q16621 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.13
NFE2Q16621 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NFE2Q16621 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms