Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNRNP35Q16560 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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