Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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