Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNAPC1Q16533 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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