Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RPE65Q16518 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RPE65Q16518 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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