Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SSX1Q16384 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SSX1Q16384 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SSX1Q16384 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SSX1Q16384 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SSX1Q16384 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SSX1Q16384 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SSX1Q16384 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SSX1Q16384 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SSX1Q16384 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SSX1Q16384 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SSX1Q16384 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SSX1Q16384 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SSX1Q16384 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
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SSX1Q16384 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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SSX1Q16384 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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SSX1Q16384 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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SSX1Q16384 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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SSX1Q16384 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SSX1Q16384 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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