Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NPTX1Q15818 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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