Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
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SYCP1Q15431 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SYCP1Q15431 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
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SYCP1Q15431 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SYCP1Q15431 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SYCP1Q15431 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SYCP1Q15431 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
SYCP1Q15431 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SYCP1Q15431 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SYCP1Q15431 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SYCP1Q15431 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SYCP1Q15431 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SYCP1Q15431 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SYCP1Q15431 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SYCP1Q15431 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SYCP1Q15431 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SYCP1Q15431 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SYCP1Q15431 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SYCP1Q15431 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
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