Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SMCO1Q147U7 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SMCO1Q147U7 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
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