Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
UBE4AQ14139 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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UBE4AQ14139 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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UBE4AQ14139 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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UBE4AQ14139 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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UBE4AQ14139 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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UBE4AQ14139 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
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UBE4AQ14139 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
UBE4AQ14139 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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UBE4AQ14139 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
UBE4AQ14139 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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