Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APOFQ13790 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APOFQ13790 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APOFQ13790 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APOFQ13790 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APOFQ13790 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APOFQ13790 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APOFQ13790 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APOFQ13790 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APOFQ13790 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APOFQ13790 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APOFQ13790 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APOFQ13790 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APOFQ13790 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOFQ13790 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOFQ13790 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOFQ13790 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOFQ13790 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOFQ13790 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOFQ13790 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOFQ13790 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOFQ13790 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOFQ13790 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOFQ13790 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOFQ13790 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOFQ13790 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APOFQ13790 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
APOFQ13790 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APOFQ13790 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APOFQ13790 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APOFQ13790 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APOFQ13790 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APOFQ13790 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APOFQ13790 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms