Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDH18Q13634 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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