Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SP140Q13342 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SP140Q13342 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SP140Q13342 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SP140Q13342 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SP140Q13342 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SP140Q13342 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SP140Q13342 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SP140Q13342 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SP140Q13342 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SP140Q13342 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SP140Q13342 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SP140Q13342 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SP140Q13342 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SP140Q13342 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SP140Q13342 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SP140Q13342 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SP140Q13342 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SP140Q13342 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SP140Q13342 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SP140Q13342 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SP140Q13342 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SP140Q13342 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SP140Q13342 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SP140Q13342 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SP140Q13342 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SP140Q13342 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SP140Q13342 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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SP140Q13342 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SP140Q13342 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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SP140Q13342 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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SP140Q13342 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SP140Q13342 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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SP140Q13342 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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SP140Q13342 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
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SP140Q13342 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SP140Q13342 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SP140Q13342 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SP140Q13342 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SP140Q13342 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SP140Q13342 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SP140Q13342 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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SP140Q13342 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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SP140Q13342 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SP140Q13342 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SP140Q13342 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SP140Q13342 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SP140Q13342 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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