Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEMA3BQ13214 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SEMA3BQ13214 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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