Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RPA4Q13156 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RPA4Q13156 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.52□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RPA4Q13156 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
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