Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CALCOCO2Q13137 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CALCOCO2Q13137 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.7 ms