Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PPFIA1Q13136 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms