Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CPSF1Q10570 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
CPSF1Q10570 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-1.49□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CPSF1Q10570 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC-1.56□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CPSF1Q10570 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
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