Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RBBP4Q09028 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms