Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
AP3M2P53677 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.52□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
AP3M2P53677 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms