Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TTPAP49638 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TTPAP49638 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
TTPAP49638 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TTPAP49638 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TTPAP49638 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TTPAP49638 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TTPAP49638 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TTPAP49638 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TTPAP49638 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TTPAP49638 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TTPAP49638 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TTPAP49638 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TTPAP49638 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TTPAP49638 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TTPAP49638 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TTPAP49638 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TTPAP49638 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TTPAP49638 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TTPAP49638 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TTPAP49638 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TTPAP49638 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TTPAP49638 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TTPAP49638 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TTPAP49638 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TTPAP49638 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TTPAP49638 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TTPAP49638 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TTPAP49638 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TTPAP49638 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TTPAP49638 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TTPAP49638 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TTPAP49638 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TTPAP49638 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TTPAP49638 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TTPAP49638 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TTPAP49638 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TTPAP49638 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TTPAP49638 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TTPAP49638 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TTPAP49638 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TTPAP49638 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TTPAP49638 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TTPAP49638 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TTPAP49638 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TTPAP49638 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TTPAP49638 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TTPAP49638 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TTPAP49638 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TTPAP49638 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TTPAP49638 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TTPAP49638 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
TTPAP49638 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TTPAP49638 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TTPAP49638 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TTPAP49638 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TTPAP49638 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
TTPAP49638 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TTPAP49638 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TTPAP49638 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TTPAP49638 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TTPAP49638 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TTPAP49638 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TTPAP49638 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
TTPAP49638 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TTPAP49638 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TTPAP49638 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TTPAP49638 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TTPAP49638 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TTPAP49638 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TTPAP49638 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TTPAP49638 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TTPAP49638 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TTPAP49638 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TTPAP49638 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TTPAP49638 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TTPAP49638 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TTPAP49638 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
TTPAP49638 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TTPAP49638 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
TTPAP49638 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
TTPAP49638 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TTPAP49638 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TTPAP49638 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TTPAP49638 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TTPAP49638 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TTPAP49638 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TTPAP49638 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TTPAP49638 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TTPAP49638 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TTPAP49638 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
TTPAP49638 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TTPAP49638 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TTPAP49638 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
TTPAP49638 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TTPAP49638 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TTPAP49638 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TTPAP49638 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TTPAP49638 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
TTPAP49638 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms