Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CENPFP49454 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CENPFP49454 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CENPFP49454 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CENPFP49454 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CENPFP49454 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CENPFP49454 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CENPFP49454 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-2.68□□□□□ -2.84
CENPFP49454 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CENPFP49454 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CENPFP49454 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CENPFP49454 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CENPFP49454 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CENPFP49454 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CENPFP49454 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
CENPFP49454 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC-2.68□□□□□ -2.84
CENPFP49454 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC-2.68□□□□□ -2.84
CENPFP49454 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CENPFP49454 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CENPFP49454 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CENPFP49454 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CENPFP49454 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CENPFP49454 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CENPFP49454 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CENPFP49454 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CENPFP49454 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
CENPFP49454 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
CENPFP49454 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
CENPFP49454 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
CENPFP49454 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
CENPFP49454 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
CENPFP49454 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
CENPFP49454 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CENPFP49454 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CENPFP49454 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CENPFP49454 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CENPFP49454 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CENPFP49454 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
CENPFP49454 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC-2.72□□□□□ -2.84
CENPFP49454 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CENPFP49454 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CENPFP49454 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CENPFP49454 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CENPFP49454 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CENPFP49454 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CENPFP49454 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
CENPFP49454 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.85
CENPFP49454 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.85
CENPFP49454 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.85
CENPFP49454 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CENPFP49454 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CENPFP49454 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CENPFP49454 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CENPFP49454 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CENPFP49454 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CENPFP49454 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CENPFP49454 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CENPFP49454 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CENPFP49454 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CENPFP49454 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CENPFP49454 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC-2.73□□□□□ -2.85
CENPFP49454 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CENPFP49454 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
CENPFP49454 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
CENPFP49454 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
CENPFP49454 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
CENPFP49454 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
CENPFP49454 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
CENPFP49454 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
CENPFP49454 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
CENPFP49454 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
CENPFP49454 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
CENPFP49454 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
CENPFP49454 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
CENPFP49454 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC-2.74□□□□□ -2.85
CENPFP49454 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
CENPFP49454 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
CENPFP49454 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC-2.75□□□□□ -2.85
CENPFP49454 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
CENPFP49454 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC-2.75□□□□□ -2.85
CENPFP49454 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
CENPFP49454 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
CENPFP49454 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
CENPFP49454 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
CENPFP49454 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
CENPFP49454 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CENPFP49454 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CENPFP49454 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CENPFP49454 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CENPFP49454 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CENPFP49454 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CENPFP49454 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CENPFP49454 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CENPFP49454 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CENPFP49454 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CENPFP49454 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CENPFP49454 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC-2.76□□□□□ -2.85
CENPFP49454 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
CENPFP49454 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
CENPFP49454 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.7 ms