Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PTPRMP28827 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 248.2 ms