Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXD10P28358 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXD10P28358 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.2 ms