Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TMOD1P28289 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.4 ms