Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CLDN9O95484 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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