Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MEIS1O00470 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
MEIS1O00470 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
MEIS1O00470 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
MEIS1O00470 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
MEIS1O00470 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS1O00470 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS1O00470 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS1O00470 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS1O00470 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
MEIS1O00470 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS1O00470 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS1O00470 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS1O00470 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS1O00470 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS1O00470 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS1O00470 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
MEIS1O00470 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS1O00470 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS1O00470 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS1O00470 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
MEIS1O00470 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS1O00470 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS1O00470 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS1O00470 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
MEIS1O00470 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS1O00470 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS1O00470 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS1O00470 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS1O00470 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS1O00470 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
MEIS1O00470 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
MEIS1O00470 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
MEIS1O00470 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
MEIS1O00470 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MEIS1O00470 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MEIS1O00470 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MEIS1O00470 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MEIS1O00470 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MEIS1O00470 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
MEIS1O00470 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MEIS1O00470 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MEIS1O00470 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MEIS1O00470 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MEIS1O00470 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
MEIS1O00470 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MEIS1O00470 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MEIS1O00470 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MEIS1O00470 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MEIS1O00470 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MEIS1O00470 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MEIS1O00470 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MEIS1O00470 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MEIS1O00470 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MEIS1O00470 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
MEIS1O00470 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
MEIS1O00470 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
MEIS1O00470 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
MEIS1O00470 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
MEIS1O00470 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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