Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC-1.38□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.38□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC-1.41□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 260 ms