Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC0.97□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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ERGIC2Q96RQ1 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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ERGIC2Q96RQ1 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ERGIC2Q96RQ1 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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ERGIC2Q96RQ1 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERGIC2Q96RQ1 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERGIC2Q96RQ1 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERGIC2Q96RQ1 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
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ERGIC2Q96RQ1 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERGIC2Q96RQ1 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERGIC2Q96RQ1 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERGIC2Q96RQ1 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERGIC2Q96RQ1 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERGIC2Q96RQ1 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERGIC2Q96RQ1 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERGIC2Q96RQ1 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERGIC2Q96RQ1 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERGIC2Q96RQ1 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
ERGIC2Q96RQ1 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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