Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SMG1Q96Q15 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
SMG1Q96Q15 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
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