Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
C9orf72Q96LT7 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
C9orf72Q96LT7 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
C9orf72Q96LT7 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
C9orf72Q96LT7 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
C9orf72Q96LT7 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
C9orf72Q96LT7 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
C9orf72Q96LT7 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
C9orf72Q96LT7 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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C9orf72Q96LT7 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
C9orf72Q96LT7 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
C9orf72Q96LT7 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
C9orf72Q96LT7 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.11□□□□□ -2.39
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C9orf72Q96LT7 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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C9orf72Q96LT7 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
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C9orf72Q96LT7 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
C9orf72Q96LT7 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
C9orf72Q96LT7 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
C9orf72Q96LT7 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
C9orf72Q96LT7 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C9orf72Q96LT7 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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C9orf72Q96LT7 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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C9orf72Q96LT7 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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C9orf72Q96LT7 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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C9orf72Q96LT7 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
C9orf72Q96LT7 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
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C9orf72Q96LT7 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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C9orf72Q96LT7 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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C9orf72Q96LT7 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
C9orf72Q96LT7 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
C9orf72Q96LT7 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
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