Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
UBXN4Q92575 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
UBXN4Q92575 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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