Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NLRC3Q7RTR2 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.9 ms