Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
USP30Q70CQ3 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
USP30Q70CQ3 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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