Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
KNOP1Q1ED39 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
KNOP1Q1ED39 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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