Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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GEN1Q17RS7 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
GEN1Q17RS7 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GEN1Q17RS7 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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