Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
IMPG1Q17R60 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.67□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
IMPG1Q17R60 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms