Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPROQ16827 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPROQ16827 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms