Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SLC18A3Q16572 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SLC18A3Q16572 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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