Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
NEDD8Q15843 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
NEDD8Q15843 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms