Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
VAMP3Q15836 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
VAMP3Q15836 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAMP3Q15836 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAMP3Q15836 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAMP3Q15836 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAMP3Q15836 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAMP3Q15836 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAMP3Q15836 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAMP3Q15836 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAMP3Q15836 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAMP3Q15836 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAMP3Q15836 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAMP3Q15836 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAMP3Q15836 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAMP3Q15836 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
VAMP3Q15836 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
VAMP3Q15836 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAMP3Q15836 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAMP3Q15836 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAMP3Q15836 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAMP3Q15836 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAMP3Q15836 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAMP3Q15836 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAMP3Q15836 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAMP3Q15836 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAMP3Q15836 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAMP3Q15836 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAMP3Q15836 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAMP3Q15836 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAMP3Q15836 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
VAMP3Q15836 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VAMP3Q15836 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VAMP3Q15836 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VAMP3Q15836 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
VAMP3Q15836 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.8 ms