Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
SIX1Q15475 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SIX1Q15475 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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