Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
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SYCP1Q15431 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
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SYCP1Q15431 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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SYCP1Q15431 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SYCP1Q15431 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
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